《御赐小仵作》讲述了明朝年间，一位聪明机智的少年周子涵被皇帝任命为御赐小仵作，负责解决宫廷内外的各种案件。在与众不同的工作中，他结识了好友、敌人和爱慕者，并从每个案件中汲取经验，逐渐成长为真正的侦探。同时，在处理案件过程中还暴露出了一些阴谋和权力斗争。最终，他用自己聪明才智成功破获了一个大型阴谋案并得到皇帝认可。