在未来，异形侵袭地球。为了打败它们，忍者组成了一支特别部队进行战斗。他们发现异形的弱点是一个叫做“黑暗水晶”的物质。于是忍者展开行动去寻找这个神秘的东西，并在途中遇到了许多挑战和危险。最终，他们成功获取到黑暗水晶并利用它消灭了所有异形，拯救了地球。