《椰林曲》讲述了一对年轻情侣因为误会而分手后，男主角前往海南岛寻找自己的根。在那里，他遇见了一位神秘女子，并意外发现她就是失散多年的母亲。经过母子之间的沟通和理解，两人终于走到了一起。同时，女主角也来到海南岛并与男主角重逢，在美丽的椰林下再次相爱。最终，三个人共同面对生活中的困难和挑战，并用音乐将感情诉说得淋漓尽致。