《学园时间停止》讲述了高中生小泉智和他的同班同学们在一次神秘事件中，发现自己能够操纵时间。为了解开这个谜团，他们开始探寻事件背后的真相，并利用时间停止的能力来解决各种问题。然而，在使用能力时也会带来意想不到的后果，让他们面临着更大的危险。最终，他们成功揭露了事件背后隐藏着一个黑暗势力所策划的阴谋，并以勇气与智慧战胜了邪恶势力，赢得了平安和自由。