在《星球大战：克隆人战争第五季》中，共和国军队与分裂势力的战斗越来越激烈。安纳金·天行者开始感受到黑暗面的诱惑，而艾丽莎也陷入了自己的危机之中。同时，新型克隆士兵开始出现，并引起了一系列问题。在这个动荡不安的时期里，各方都将面临前所未有的挑战和考验。