《夏目友人帐第二季》讲述少年夏目贵志和他的妖怪朋友们之间的故事。在这一季中，夏目与新结识的妖怪小狸爱上了同一个男孩，引起了不少纷争；同时，受到神秘组织“鬼面”的追杀，夏目必须寻找自己过去与“鬼面”之间的联系，并保护身边重要的人们。最终，在伙伴们和妖怪们的帮助下，夏目成功解决了危机，并更加深入地理解了自己与妖怪世界之间复杂而美好的关系。