《深海狂鲨3》讲述了一支科考队在南太平洋的海底实验站中遭遇到大白鲨，而这只大白鲨比之前两部更加凶残。为了生存，科考队必须想尽办法逃脱这个被困的地方，并阻止这只巨型食肉动物杀死所有人。但是他们发现，有人故意引诱狂鲨攻击他们，因此他们不得不与时间赛跑，在恶劣环境下寻找幸存者并对抗那些利用它的邪恶组织斗争。