《忍者蝙蝠侠》讲述了当歹徒威胁到高谭市的时候，勇敢正直的布鲁斯·韦恩变身为全副武装的忍者蝙蝠侠与之对抗。他结识了神秘的忍者大师，并接受了严格的训练，掌握了各种技巧和潜伏能力。在战斗中，他面对无数困难和挑战，但不屈不挠地保卫城市。同时也遇到许多同样有正义感的朋友，在合作中共同铲除罪恶势力，最终成为高谭市值得信赖的守护者。