《pr社萌汁BT种子》讲述了一个热衷于动漫的小青年加入了一个制作二次元内容的社团，而这个社团有一天突然收到了一颗神秘的BT种子。当他们播放这颗种子时，屏幕里跳出了一个可爱的女孩形象，并宣称自己是动漫角色，因为穿越至现实世界而需要帮助。由此展开一系列欢乐、奇特又充满想象力的故事，社员们与这个来自二次元世界的角色相互帮助着，在冲破人与虚拟之间隔阂中形成深厚友谊和共同成长。