《末代御医国语》讲述了清朝时期的皇室御医，因为治愈了乾隆帝的病而被封为“药王”。但是他却发现自己所用的草药中有一种致命毒素，这种毒素来源于一个神秘组织，目标是要暗杀皇帝。御医决定揭露真相并保护皇帝不受威胁。在追查过程中，他结识了一位女子，并逐渐陷入情感纠葛。最终，在与神秘组织展开激战后，御医成功拯救了皇帝和整个国家，并与心爱之人走向幸福生活。