《监狱学园》讲述了一个名为“监狱学园”的特殊高中，校内的一切都像个真正的监狱。在这里，每个人都有自己的身份和规则，必须遵守。主角芦屋零是新生之一，在适应期间与其他女孩结成联盟，并试图打败强大而不公平的委员长桐島绫子。故事充满着紧张、悬疑和惊险，同时也深入探讨社会问题以及人性本质等议题。