在第一部的结尾，史瑞克成功拯救了公主费奥娜并成为了国王。但他很快就面临新的危机：一个名为“人类”的组织计划消灭所有的妖怪。于是，史瑞克和他的朋友们展开了一场冒险之旅，希望能够阻止这个邪恶计划。同时，费奥娜也发现自己有着秘密过去，并将其与史瑞克分享。两人最终战胜了人类组织，并迎来了新生命——小龙虾。