《碟中谍2》讲述了世界各地的机密文件被盗，伊森·亨特（汤姆·克鲁斯）与他的团队必须阻止恐怖分子利用这些文件制造一种名为“猪流感”的致命病毒。在行动过程中，伊森遇到了前女友纳莉（泰德拉·斯维顿），她成为了他们行动的关键人物。但是，在执行任务时，团队成员一个接一个地死亡，最后只有伊森和另一位同事生还，并成功挫败了恐怖分子的计划。