大侦探皮卡丘与小伙伴踏上解开失踪父亲之谜的冒险之旅，意外发现镇上有一只神秘的宝可梦Mewtwo。随着调查深入，皮卡丘感觉身体发生了奇怪的变化，开始能够说话并熟练使用人类话语。最后，在困境中求助于唯一的证人之后，揭开了一个惊天骗局：他本来就是那个失踪已久的真正主角Tim Goodman！