第六季狄仁杰与团队来到神秘的深海龙宫，调查失踪案件。在探索过程中，他们发现了一个神秘的黑色液体，并遭遇了千年一遇的大洪水。为了解开谜团，狄仁杰决定下潜寻找真相。在深海龙宫里，他们发现了隐藏已久的古代文物和珍贵艺术品，并揭露出背后隐藏着一个巨大阴谋。最终，在众人合力助攻下，成功将罪犯缉拿归案并保护好古迹文物不被毁坏。