《PHI·BRAIN 神之谜题 第二季》的剧情简介：在破解了迷宫王P.O.G.的游戏后，主人公红叶达也与好友们迎来了新的挑战。这一季，神秘组织Orm试图招募他们，并暗中跟踪红叶。同时，众人参加Phi Brain锦标赛，并遭遇强大对手阻击。在推理和智慧的考验下，他们不仅要保护自己，还要找出Orm背后的真正目的并争取解放被控制的朋友。