在《星球大战：克隆人战争第三季》中，共和国与分裂势力的冲突进一步升级。安纳金成为了绝地议会的代表，并开始调查奥多阿行星上神秘的克隆军团。同时，达斯·西迪厄斯和他的学徒桑帝发起了大规模攻击，试图摧毁共和国并掌握银河系。另一方面，奥比万领导着小队执行任务，在前线与敌人激烈交火。最后，在各种挑战和牺牲之后，共和国成功捍卫了自己，并展开对抗分裂势力更加强有力的计划。