故事发生在古代，地球正面临着神秘的外星势力侵略。一位传奇勇士被遣送来到地球，他就是欧布奥特曼。初次降临时，他变身为一名普通人类，协助科学家研究对抗外星人的能源源泉“原生之初”。然而，利益纷争中难以活动空间让人彼此各怀鬼胎。同时，更强大的外星恶势力即将降临地球，并对原生之初产生觊觎之心。在战斗与​团结​​​中逐渐成长的欧布奥特曼和地球上各个领域里的超凡英雄们决定携手合作，保护原生之初并赢得最后胜利。