《秘密的时光》讲述了一个少女在偶然间发现一台神奇的时光机器后，踏上了穿越时空的旅程。她来到不同年代，结识各种人物，并解开了这些人物所隐藏的秘密。然而，在回到现实后，她才意识到自己也有着一个重要的秘密：父亲竟是另一个时间线上的存在。为了保护家庭和未来，她决定放弃这段难以言说的经历，继续过着平凡生活。