《火线追凶2之鹈鹕行动》讲述了特警队员李博和团队在抓捕毒枭过程中，意外发现其背后竟涉及一起国际恐怖组织的阴谋。为揪出真相，他们展开了一场跨越多个国家、充满危险的行动——“鹈鹕计划”。在与时间赛跑的过程中，他们不仅面对着高强度武装袭击和生死考验，还要经历内部矛盾和情感纠葛。最终，在全剧紧张悬疑的气氛下，他们成功完成任务并打击了恐怖势力。