大内医探于明朝嘉靖年间，讲述了宫廷医生李时中和女侠燕小兰的故事。他们一同解决了一系列神秘案件，包括皇帝被迷药暗算、太子险遭刺杀等。在调查中，两人不仅揭开了黑幕，还发现了自己之间的情感纠葛。最终，在举国欢庆的氛围下，二人携手走向未来。本剧以大量历史元素为基础，并加入惊险刺激的推理部分和浪漫感动的爱情线索，深受观众喜爱。