《1612动乱时代》讲述了明朝晚期，北方农民起义波及全国，南明政府在内忧外患中苦苦支撑。主人公杨士奇为救父亲被迫加入军队，他与好友蔡锷一同参与镇压叛乱。然而，在战斗中杨发现自己所站立的阵营并非正义之师。最终他选择背离原来的信仰，成为反抗者领袖，并率领群众推翻暴政。影片通过一个小人物的经历展示了那个混沌年代里人们对于权力、荣誉和信仰的探索和挣扎。